Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms