Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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