Protein–RNA interactions for Protein: P70451

Fer, Tyrosine-protein kinase Fer, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FerP70451 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FerP70451 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FerP70451 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FerP70451 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FerP70451 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FerP70451 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FerP70451 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FerP70451 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FerP70451 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FerP70451 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FerP70451 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms