Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms