Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cux2P70298 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cux2P70298 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms