Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NficP70255 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NficP70255 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NficP70255 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NficP70255 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms