Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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