Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms