Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo40P62932 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo40P62932 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms