Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms