Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms