Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpfP62307 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms