Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp46P62069 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp46P62069 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp46P62069 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp46P62069 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp46P62069 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp46P62069 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp46P62069 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp46P62069 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp46P62069 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp46P62069 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp46P62069 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms