Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2fP61219 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms