Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3bP59470 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr3bP59470 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms