Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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CtdsplP58465 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtdsplP58465 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms