Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpa1P57784 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms