Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms