Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp1P56716 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms