Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5bP56480 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5bP56480 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5bP56480 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5bP56480 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms