Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms