Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcanP55066 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcanP55066 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcanP55066 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcanP55066 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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