Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms