Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Faf1P54731 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Faf1P54731 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Faf1P54731 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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