Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad23aP54726 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms