Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms