Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccr5P51682 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms