Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms