Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cav1P49817 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms