Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnni3P48787 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms