Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LmnaP48678 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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