Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx2P48379 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms