Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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