Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrprbP47758 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms