Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf7P43029 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms