Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TfamP40630 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TfamP40630 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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