Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VhlP40338 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VhlP40338 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VhlP40338 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VhlP40338 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VhlP40338 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms