Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtlP38585 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtlP38585 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtlP38585 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtlP38585 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtlP38585 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtlP38585 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtlP38585 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtlP38585 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms