Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpargP37238 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpargP37238 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms