Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms