Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp4P35123 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp4P35123 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp4P35123 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp4P35123 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp4P35123 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp4P35123 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp4P35123 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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