Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms