Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp13P33435 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms