Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxa2P31245 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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