Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnd1P30999 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms