Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VtnP29788 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VtnP29788 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VtnP29788 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VtnP29788 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VtnP29788 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VtnP29788 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms