Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms