Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrgP28705 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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