Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms