Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms